Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacnb3P54285 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms