Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Map3k1P53349 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map3k1P53349 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms