Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms