Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa6P50704 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa6P50704 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms