Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VegfbP49766 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VegfbP49766 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VegfbP49766 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms