Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpreP49446 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms