Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms