Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms