Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl13P47963 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms