Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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