Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nedd4P46935 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms