Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sdc2P43407 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sdc2P43407 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sdc2P43407 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc2P43407 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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