Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms