Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms