Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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