Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms