Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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