Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col2a1P28481 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms