Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb1P28230 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms