Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Psmb9P28076 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb9P28076 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms