Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms