Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd12P23812 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms