Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ggta1P23336 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ggta1P23336 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ggta1P23336 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms