Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms