Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pou5f1P20263 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms