Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms