Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RargP18911 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RargP18911 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RargP18911 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RargP18911 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RargP18911 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RargP18911 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RargP18911 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms