Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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Hoxb1P17919 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxb1P17919 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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