Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PcnaP17918 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms