Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sptan1P16546 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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