Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim30aP15533 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim30aP15533 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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