Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms