Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DmdP11531 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DmdP11531 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DmdP11531 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DmdP11531 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DmdP11531 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DmdP11531 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DmdP11531 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
DmdP11531 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DmdP11531 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DmdP11531 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DmdP11531 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DmdP11531 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DmdP11531 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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DmdP11531 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DmdP11531 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DmdP11531 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms