Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd3P09027 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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