Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms