Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-T23P06339 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-T23P06339 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms