Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa7P02830 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa7P02830 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms