Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AfmO89020 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AfmO89020 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AfmO89020 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AfmO89020 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms