Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcxO88809 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcxO88809 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcxO88809 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcxO88809 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcxO88809 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DcxO88809 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DcxO88809 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DcxO88809 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DcxO88809 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcxO88809 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms