Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlkO54988 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlkO54988 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlkO54988 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SlkO54988 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SlkO54988 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SlkO54988 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SlkO54988 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SlkO54988 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SlkO54988 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SlkO54988 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlkO54988 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms