Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DffaO54786 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DffaO54786 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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DffaO54786 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DffaO54786 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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