Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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