Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timm44O35857 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms