Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cited2O35740 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cited2O35740 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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