Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptch2O35595 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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