Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmiO35309 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmiO35309 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmiO35309 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NmiO35309 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmiO35309 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmiO35309 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmiO35309 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmiO35309 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmiO35309 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmiO35309 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmiO35309 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmiO35309 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms