Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms