Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms