Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms