Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms